请问一下计算图片中的物体长宽有什么好的思路么

[kangsgo]

示例图片如下:

我想计算大肠杆菌的长宽（图片有像素和尺寸换算比例），有什么好的思路么。 我用mahotas只能算周长。

现在知道的一个笨方法就是用ImageJ进行一个一个计算，但是有上千个，感觉压力好大。所以想请问一下有什么好的思路或者模块可以实现么，谢谢~

图片（防止上面的不显示） https://static.independent.co.uk/s3fs-public/styles/article_small/public/thumbnails/image/2016/05/26/19/pg-12-superbugs-getty.jpg

[Hzzone]

ImageJ 是手工算的吗？
可以试一下：
取个阈值把细菌给分割出来，然后长宽就大致取个内切和外接圆的直径...

[Hzzone]

这样一次就能做完，但是准确多不敢保证..你可以把效果图用 matplotlib 或者 opencv 画出来看一下

[northisland]

ppm

[shuianfendi6]

不懂计算机图形学

分离红色通道，然后边缘特征提取

[kangsgo]

@Hzzone 是的，ImageJ 要手工操作。好的，谢谢，我试一下
@northisland ppm 这个 python 包我看好像是转格式的？
@shuianfendi6 边缘提取以后好操作计算么？

[Kilerd]

灰度化，然后找跟目的颜色 +- xx 的像素点不行吗？

[kangsgo]

@Kilerd 可以，但是这个只是画出轮廓，现在关键步数就是不知道怎么计算到长宽···

[shuianfendi6]

@kangsgo 边缘提取分割出子区域，长宽有明显分界线算子像素距离就好了，或者直接数灰度超过多少的像素面积，用长度或者宽度反求，异常的图片保存下来人工处理呗
至少这个图红色通道特征还是蛮明显的，边缘特征感觉用阈值就可以了

[MinQ]

@kangsgo 最小包围矩形，MinAreaRect，把每个大肠杆菌的轮廓带进去就行了

[northisland]

@kangsgo pixel per square meter

每平米像素数量

[xuchkang171]

试试 Halcon?

很久前用其他语言调 Halcon 做过类似的事情。

[kangsgo]

@xuchkang171
@northisland
@MinQ
@shuianfendi6
好的，非常感谢

[ChenJinluo]

老哥你是学生物的？

[angchouas]

如果你会用 python 的话，我推荐你一个方法，主要使用一个叫 skimage 的包。

先把图片滤波，把噪声去掉。

然后把边缘提取出来，删掉不完整的。Label 之后再 regionprops，得到边缘的坐标和质心坐标。

距离质心最长的就是半长轴，最短的就是半短轴，翻倍之后就是长和宽。

[kangsgo]

@ChenJinluo 嗯嗯，是的

@angchouas 好的，我就是用这种方法做了，谢谢您~