曾遇到过类似的情况，对mysql不是很懂，把当时的步骤总结一下，希望帮到楼主：
环境：512M内存的vps，mysql 5.6，搭了wordpress
问题：mysql能启动，wordpress一被访问，数据库就crash
尝试1：将innodb_buffer_pool_size=128M 改为5M，wp可以访问了，只是坚持不了多久还会down
尝试2：
调整以下参数至：
performance_schema_max_table_instances=600
table_definition_cache=400
table_open_cache=256
这时mysql启动后内存就只占用40–60M内存了
以下是5.6默认的设置，会占用至少400M的内存，可能是导致crash的原因
performance_schema_max_table_instances 12500
table_definition_cache 1400
table_open_cache 2000
尝试3：经过尝试2后，问题解决了。但一个月后随着文章的增多，数据库又crash掉，直接动态扩展了vps内存到1G 问题彻底解决

综上感觉内存不足是最可能的主因